La Secretaría General tiene la misión de conducir la FATLyF sobre la base de los lineamientos orgánicos, doctrinarios y filosóficos fundantes, dándole vida a un hacer con compromiso y gestión federal que represente a todos sus integrantes.
Es su responsabilidad administrar la Organización, coordinando una eficiente tarea entre las diferentes áreas; asegurando el fiel cumplimiento de las decisiones emanadas de los Congresos Ordinarios y Extraordinarios.